Q1. Mupid와 같은 소형 전기영동장치와 대형 전기영동장치의 어떻게 구분하여 사용하면 되나요?
Mupid와 같은 소형 전기영동장치는 빠르게 전기영동을 진행할 수 있기 때문에 plasmid, PCR product 분석에 사용하기 적합합니다.
대형 전기영동장치는 해상도가 좋고, 전압 및 전류의 조절이 가능하기 때문에 전기영동 시간을 조절 할 수 있습니다.
또한 gel size가 크기 때문에 한 번에 많은 양의 샘플 분석을 수행할 수 있습니다.
Q2. DNA 샘플이 well에 잘 들어가지 않습니다. 어떻게 해야 하나요?
Q3. plasmid를 제한효소 처리 후 전기영동하면 수백 bp 부근에 강한 염색상이 퍼져 보입니다. 왜 그런 건가요?
Plasmid DNA와 함께 추출된 RNA(주로 rRNA) 일 수 있습니다.? Plasmid DNA prep시 RNase 를 처리하지 않는 경우, 수백 bp 부근에 진한 염색상이 보일 수 있습니다.
이것은 E.coli transformation, 제한효소 처리, PCR 반응에 영향을 주지 않습니다. RNase A를 loading buffer에 넣거나, plasmid DNA 추출시 RNase A를 처리하면 이 염색상은 사라집니다.
Q4. 전기영동 중에 gel을 보면, loading dye가 활 모양으로 되어 전기영동 되고 있습니다. 왜 그런건가요?
고전압에서 전기영동을 하면 gel의 온도가 균일하지 않아 젤 가장자리와 중앙의 온도가 달라져 loading dye가 활 모양으로 전기영동되는 현상이 발생합니다. gel 전체를 냉각하거나 전압을 낮추어 전기영동하면 이런 현상은 일어나지 않습니다.
