- 빠르고 간단한 프로토콜 - Strand 정보 (sense/antisense)를 가진 Illumina® sequencing-ready library를 7시간만에 제작
- Single cell 수준까지 적용 가능 - 1-1,000 intact mammalian cell 혹은 10 pg - 10 ng의 low/high-quality mammalian total RNA 적용
- 높은 재현성과 정확도로 분석 - Single cell 또는 total RNA로부터 full-length의 coding/non-coding transcript를 재현성과 정확도 높게 분석
- Single cell RNA-seq의 gold standard SMART-Seq® mRNA LP (with UMIs) (Code 634762 외) 수준의 높은 민감도
제품설명
SMART-Seq® Total RNA Single Cell (ZapR™ Mammalian)은 random primer를 사용하여 효과적으로 whole transcriptome을 분석할 수 있는 제품이다. 또한 single cell 레벨에서 nonpolyadenylated transcripts를 분석할 수 있다. Stranded sequencing library 제작을 위해 cDNA 합성 및 amplification 시약, ZapR 기반 ribosomal RNA (rRNA) 제거시약 그리고 Illumina®용 library 제작시약이 포함되어 있다.
이 제품은 당사의 독자적인 SMART (Switching Mechanism at 5’ end of RNA Template) 기술에 stranded RNA-seq을 위한 개선사항을 더해 프로토콜을 간편화하고 sequencing 효율을 높였다. 또한 RT 단계에서 random primer를 사용해 nonpolyadenylated transcript를 포함하는 full transcriptome 분석이 가능하다.
Single cell 수준까지 적용 가능한 사용자 친화적인 간단한 프로토콜과 rRNA 유래 cDNA 제거 시약 (ZapR™ mammalian)은 고감도로 재현성 높으며 rRNA mapping이 낮은 데이터를 얻을 수 있다. 따라서 별도의 rRNA 제거 kit 없이 strand 정보 (sense /antisense)를 가진 sequencing library를 고효율로 제작할 수 있다.
oligo dT primer를 사용하고자 한다면 SMART-Seq® mRNA LP (with UMIs) (Code 634762 외) 제품을 추천한다.
그림 1. SMART-Seq® Total RNA Single Cell (ZapR™ Mammalian) 프로세스.
적용
- 극소량 (1-1,000) mammalian cell 및 total RNA (10 pg - 10 ng)에서 7시간만에 Illumina® 플랫폼용 sequencing library 제작
- Strand 정보를 가진 whole transcriptome sequencing
자세한 구성은 CoA를 참고하세요.
RNA-Seq 러닝센터에서 더 많은 데이터와 FAQ를 확인하실 수 있습니다.
